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本報(bào)訊（記者 李爭(zhēng)粉）12月3日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所（嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實(shí)驗(yàn)室深圳分中心）王桂榮課題組聯(lián)合崔鵬課題組以“果蔬殺手”橘小實(shí)蠅為研究對(duì)象，成功構(gòu)建了迄今為止在小個(gè)體高雜合害蟲中最完整的基因組圖譜。

該研究不僅填補(bǔ)了橘小實(shí)蠅現(xiàn)有參考基因組中缺失的片段，證明了小個(gè)體昆蟲能夠邁入T2T基因組時(shí)代，為發(fā)現(xiàn)基于害蟲功能基因組學(xué)手段的防控分子靶標(biāo)提供了新思路。相關(guān)研究成果發(fā)表在《自然通訊（Nature Communications）》上。

橘小實(shí)蠅，因其食性雜、寄主廣、繁殖力強(qiáng)，被稱為果蔬界的“頭號(hào)殺手”?；蚪M圖譜是解析橘小實(shí)蠅生理特性，開發(fā)針對(duì)性綠色防控技術(shù)的基礎(chǔ)?，F(xiàn)有橘小實(shí)蠅參考基因組大多基于混合個(gè)體組裝，尤其是在中心粒、性染色體這些區(qū)域有較多的“空白”。

研究團(tuán)隊(duì)綜合利用多種三代測(cè)序技術(shù)，以單個(gè)體雄蟲的測(cè)序數(shù)據(jù)作為基本骨架，整合群體數(shù)據(jù)，成功組裝出了大小近600Mb的基因組。與其他橘小實(shí)蠅基因組參考版本相比，新的基因組版本首次實(shí)現(xiàn)了從端粒到端粒的無缺口完整覆蓋，填補(bǔ)了以往基因組中高度重復(fù)的復(fù)雜區(qū)域留下的空白。研究在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步解析了中心粒，性染色體等高重復(fù)結(jié)構(gòu)區(qū)域，挖掘出了Y染色體特異性基因和氣味受體等潛在的綠色防控技術(shù)靶標(biāo)，為害蟲綠色防控技術(shù)的研發(fā)與優(yōu)化提供了高質(zhì)量參考基因組資源。

該研究得到深圳市科技計(jì)劃資助，深圳市大鵬新區(qū)科技創(chuàng)新和產(chǎn)業(yè)發(fā)展專項(xiàng)資金資助項(xiàng)目，國家重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程，國際原子能機(jī)構(gòu)協(xié)調(diào)研究等項(xiàng)目支持。

圖片來源：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所