記者2025年12月31日從云南省科技廳獲悉,首款云南地方豬100K液相育種芯片“滇芯1號(hào)”已正式發(fā)布,這一成果標(biāo)志著云南省在地方豬基因組育種領(lǐng)域取得關(guān)鍵突破,為高原特色現(xiàn)代生豬種業(yè)高質(zhì)量發(fā)展注入強(qiáng)勁科技動(dòng)力。
云南作為我國(guó)地方豬種資源大省,境內(nèi)迪慶藏豬、滇南小耳豬、麗江豬、大河豬、撒壩豬等地方豬種在高原獨(dú)特生態(tài)環(huán)境中演化,遺傳結(jié)構(gòu)復(fù)雜且性能差異顯著,對(duì)品種鑒定、親緣關(guān)系核驗(yàn)等環(huán)節(jié)的分子工具提出了更高要求。而現(xiàn)有商業(yè)化豬SNP芯片多以瘦肉型豬種為設(shè)計(jì)基礎(chǔ),難以適配云南地方豬種質(zhì)資源保護(hù)與精準(zhǔn)育種的實(shí)際需求。

為破解這一難題,云南農(nóng)業(yè)大學(xué)嚴(yán)達(dá)偉教授領(lǐng)銜的高原地方豬基因資源發(fā)掘與利用團(tuán)隊(duì),聯(lián)合華中農(nóng)業(yè)大學(xué)趙書(shū)紅院士團(tuán)隊(duì)及武漢影子基因科技有限公司,開(kāi)展專(zhuān)項(xiàng)研發(fā)工作。團(tuán)隊(duì)對(duì)10個(gè)云南地方豬種進(jìn)行高深度全基因組重測(cè)序,篩選高質(zhì)量變異位點(diǎn),成功構(gòu)建包含10.8509萬(wàn)個(gè)高多態(tài)性SNP位點(diǎn)的專(zhuān)用高密度分子標(biāo)記體系。該體系不僅覆蓋生長(zhǎng)、繁殖、肉質(zhì)、抗逆等重要經(jīng)濟(jì)性狀位點(diǎn),還建立了針對(duì)云南地方豬的高分辨率品種鑒別標(biāo)記,可全面支持品種鑒定、外來(lái)血緣監(jiān)測(cè)、群體純度評(píng)估等多項(xiàng)工作。

測(cè)試結(jié)果顯示,“滇芯1號(hào)”平均位點(diǎn)檢出率達(dá)98.99%,芯片分型結(jié)果與全基因組重測(cè)序的一致率高達(dá)99.87%,整體性能穩(wěn)定可靠。其應(yīng)用場(chǎng)景廣泛,可用于云南地方豬遺傳距離評(píng)估、種質(zhì)資源指紋圖譜構(gòu)建、育種材料篩選及性狀調(diào)控位點(diǎn)挖掘等研究與實(shí)踐工作,為地方豬種質(zhì)資源保護(hù)和基因組育種提供了標(biāo)準(zhǔn)化、低成本、高通量的便捷工具。

據(jù)介紹,該成果得到云南省趙書(shū)紅專(zhuān)家工作站項(xiàng)目和云南省重大科技專(zhuān)項(xiàng)項(xiàng)目支持,是云南省持續(xù)推進(jìn)地方畜禽種質(zhì)資源保護(hù)與育種科技創(chuàng)新的重要成果,將為云南地方豬精準(zhǔn)育種提供有力技術(shù)支撐,助力高原特色生豬產(chǎn)業(yè)提質(zhì)增效。
(云南農(nóng)業(yè)大學(xué)供圖)
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